Les eaux brunes sont le mélange de Fèces et d’Eau de Chasse, mais qui ne contient pas d'Urine.

Ces eaux sont générées par les Toilettes à Séparation d'Urine (U.6) et par conséquent, leur volume dépend du volume de l'Eau de Chasse utilisé. Les charges d‘agents pathogènes et de nutriments présents dans les Fèces ne sont pas réduites, elles sont seulement diluées par l'Eau de Chasse.

Les Eaux Brunes peuvent également inclure l’Eau de Nettoyage Anal (si l'eau est utilisée pour le nettoyage) et/ou les Matériaux de Nettoyage Anal (voir la figure).